1、导致男性阳痿、早泄等性功能障碍。隐匿性包茎主要导致男性在性生活中龟头无法外露，龟头刺激受阻，在性生活中容易出现射精障碍、早泄、阳痿等性功能障碍，长期下去还会导致男性对性生活失去兴趣，对男性生育的影响也是非常大的。
2、防碍男性阴茎的正常发育。隐匿性包茎患者的龟头长期被包在包皮内无法正常外露，使得男性阴茎与龟头发育受到限制，从外表看会有小阴茎的感觉，不仅对性生活及生育有影响，还会导致男性自卑等不良心理因素的形成。
3、引发炎症。隐匿性包茎导致龟头无法正常外露，阴茎内滋长大量的包皮垢，容易诱发炎症，包皮垢是细菌繁殖的最好场所，不及时治疗还会引发包皮龟头炎、前列腺炎，还会感染炎症在性生活中带入到性伴侣体内，引发妇科炎症。
4、出现嵌顿性包茎。隐匿性包茎需要用手翻出包皮才能看到龟头，包茎翻过冠状沟时，紧缩的包皮口冠状沟形成嵌顿环，引起嵌顿性包茎，使阴茎处血液循环受到阻碍，包皮龟头充血水肿，感染或龟头坏死。
5、有损肾脏功能。隐匿性包茎会导致阴茎发炎，炎症会引起尿道口或前尿道狭窄，造成男性排尿困难，男性长期排尿困难对肾脏的功能是有害的。